Cell | 体细胞激活或抑制状态决定了核小体分离的差异性

2021-10-12 12:58:12 来源:
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肝细胞内部结构通过促进或减缓该内部结构的核苷酸可以控制蛋白质组的功能和细胞理应推定。这些肝细胞内部结构中都普遍存在特定的核糖翻译后结构上(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定核苷酸状况相关,并可促进减缓性基因内部结构的形成,阻碍蛋白质的解读。为了在细胞器时依然依然特异性程序的完整性,决定肝细胞内部结构的小分子特征也需要在子代细胞中都组织起来。组织起来不尽不同类改型肝细胞状况的重要决定因素是核糖PTMs,合而为一要普遍存在于核糖H3和H4的四肢上。因此,在细胞器的更进一步中都,除了DNA激活,互补核小体也需要复建,并调配到子代细胞中都。确实,学术研究注意到互补的定格核糖(比如激活仰赖的核糖)会在激活叉后急剧再一组装。不尽不同的学术研究组注意到H3K9me3和H3K27me2/3可通过细胞周期基因。然而,这两个核糖结构上都是与减缓性肝细胞内部结构相关。那么,互补中都的核小体,以及它们空投的核糖PTMs是否都能基因到子代细胞不同的蛋白质座席上呢?来自耶鲁大学兰戈恩医学中都心的Danny Reinberg任教课题组在Cell发表学术研究Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该学术研究注意到在DNA激活时,诱导与受减缓肝细胞周围的核小体复合是不尽不同的。受减缓肝细胞内部结构中都的核小体会被送至在子代细胞不同的蛋白质周围,而诱导改型肝细胞内部结构中都的核小体的调配则是辐射和随机的。为学术研究核小体的复合也许,科学界在候选蛋白质座席不可逆的标有核糖H3.1和H3.2,以监控小鼠胎盘细胞培养中都核小体在细胞器时的波动。简单来说,该方法通过位处蛋白标有技术,利用CRISPR为特定蛋白质座席的H3.1和H3.2带上谷氨酸标有,经ChIP-qPCR监测该谷氨酸标有在核苷酸G1期和S期的轻元素,以反应核小体的复合也许。若该底物H3.1和H3.2上的谷氨酸标有在一次细胞器后下降一半,说明该核小体被送至在了两个子代细胞的不同蛋白质座席上;若该谷氨酸结构上慢慢地消失,说明子代细胞没有基因该蛋白质座席的核小体。科学界首先监测了在胎盘细胞培养中都梦魇解读的Hoxc6, Ebf1, Meis2蛋白质的核小体复合也许。这些蛋白质座席的核小体谷氨酸水平随细胞器逐渐缩减到,这上会受减缓的蛋白质座席的核小体会被送至在子代细胞的不同前方。这与今人注意到的H3K9me3和H3K27me2/3可通过细胞周期基因的自然现象相印证。那么,诱导改型肝细胞周围的核小体又是如何复合的呢?科学界监测了在胎盘细胞培养中都被诱导解读的Ccna2, Nanog和Pou5f1蛋白质,注意到该蛋白质座席的谷氨酸标有在细胞器后长方形辐射状况,轻元素较低,这上会对于诱导改型肝细胞周围来说,互补核小体没有人精确的调配到子代细胞可视的蛋白质座席,而是随机调配的。更奇怪的是,在诱导胎盘细胞培养分化时,Hoxc6蛋白质由减缓变为诱导,它的核小体调配模式也由精确的同底物调配改为随机调配。这说明互补核小体的局部调配,可以说明了该肝细胞周围的活性状况。总的来说,该学术研究通过CRISPR驱使的核糖谷氨酸标有子系统,学术研究了核小体在细胞器更进一步中都的调配方式,并注意到诱导与受减缓的肝细胞周围的核小体调配方式的不尽不同。值得注意的是,在核苷酸的S期中都,受减缓的肝细胞周围的激活要晚于诱导改型肝细胞周围。这个时间区别也致使常肝细胞的激活速率大于异肝细胞。异肝细胞相对较慢的激活更快也许保证了核小体的精确调配,而常肝细胞中都的PTMs则由可视的合而为一调节因子(master regulators)如此一来识别可视DNA序列,并招募PTMs酶再一组织起来。原始出处:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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